More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4137 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
298 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  71.82 
 
 
297 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  69.28 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  71.33 
 
 
295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  67.58 
 
 
295 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  51.03 
 
 
295 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  51.37 
 
 
295 aa  325  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  48.47 
 
 
296 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  51.88 
 
 
295 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  49.83 
 
 
296 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  50 
 
 
295 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  50 
 
 
295 aa  319  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  52.22 
 
 
295 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  49.32 
 
 
295 aa  315  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
295 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  47.77 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  49.66 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  51.74 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  48.85 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  50.85 
 
 
295 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  47.59 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  50.87 
 
 
305 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 
307 aa  300  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  48.2 
 
 
326 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  48.2 
 
 
326 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  47.27 
 
 
320 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  48.2 
 
 
326 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  48.2 
 
 
320 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 
303 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  46.95 
 
 
320 aa  295  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  48.97 
 
 
296 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  47.23 
 
 
331 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  48.29 
 
 
295 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  44.83 
 
 
294 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  50.99 
 
 
254 aa  278  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  45.89 
 
 
291 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  44.18 
 
 
291 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  41.22 
 
 
295 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  45.33 
 
 
310 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  39.31 
 
 
293 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  49.64 
 
 
145 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  36.71 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  54.46 
 
 
116 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  32.78 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  29.67 
 
 
305 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  35.11 
 
 
227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.6 
 
 
232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  32.77 
 
 
236 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 
232 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
250 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  34.17 
 
 
318 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 
230 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.06 
 
 
230 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.06 
 
 
230 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  31.94 
 
 
290 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 
230 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.07 
 
 
278 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
409 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 
230 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  31.48 
 
 
290 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 
248 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 
409 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  30.84 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  33.49 
 
 
241 aa  99.4  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  31.46 
 
 
223 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 
415 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
415 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
222 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  29.57 
 
 
223 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 
232 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 
420 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 
246 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 
292 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  29.34 
 
 
257 aa  95.9  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 
415 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 
415 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  27.84 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 
263 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  28.14 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  28.14 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  27.55 
 
 
322 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.12 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  29.02 
 
 
433 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
409 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 
251 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.47 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 
271 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>