More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5319 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  85.2 
 
 		 223 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  52.02 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  50.22 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  43.24 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  46.72 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  45.95 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  44.39 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  46.09 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  45.41 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  45.41 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  42.98 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  46.09 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  37.21 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  41.74 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  40.18 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  42.2 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  42.2 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  41.74 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  40.74 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  38.03 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  42.2 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  38.5 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  41.56 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  41.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  42.11 
 
 		 420 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  38.5 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  40.37 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  41.01 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  35.71 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  41.94 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  38.71 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  40.27 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  39.09 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  39.46 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  41.1 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  36.79 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  38.94 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  40.93 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 245 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 407 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  33.92 
 
 		 407 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  36.8 
 
 		 433 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  39.21 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  40.89 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  38.49 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  35.93 
 
 		 409 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  35.59 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  39.05 
 
 		 408 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  35.56 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  40.69 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 		 302 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  35.24 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  36.86 
 
 		 275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 		 297 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  35.53 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  35.17 
 
 		 297 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  34.8 
 
 		 413 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5888  putative carboxymethylenebutenolidase(dienelactone hydrolase  37.73 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284231  normal  0.610452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 415 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  35.19 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  33.96 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 		 291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  35.16 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 		 268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  34.47 
 
 		 290 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  34.47 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  34.47 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  34.18 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 411 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  34.03 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  36.8 
 
 		 295 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  36.8 
 
 		 295 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.12 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 		 291 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 415 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  37.23 
 
 		 295 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 415 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  36.36 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 		 415 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  35.04 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>