More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5021 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  61.37 
 
 
231 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  56.84 
 
 
233 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  52.09 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
433 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  47.88 
 
 
409 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  45.99 
 
 
420 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  48.12 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  48.44 
 
 
411 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  48.66 
 
 
407 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  47.32 
 
 
407 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  47.77 
 
 
232 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  46.43 
 
 
410 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  44.54 
 
 
413 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  46.35 
 
 
415 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  46.35 
 
 
415 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  46.35 
 
 
415 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  45.06 
 
 
409 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  45.06 
 
 
232 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  45.49 
 
 
409 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  43.7 
 
 
413 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  43.72 
 
 
236 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  43.35 
 
 
415 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  42.19 
 
 
232 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  39.04 
 
 
234 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  42.13 
 
 
408 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  41.03 
 
 
236 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 
230 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 
230 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  39.48 
 
 
232 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
230 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  47.03 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  37.07 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
232 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  42.49 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
236 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  38.63 
 
 
237 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  37.77 
 
 
230 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  40.77 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  41.35 
 
 
222 aa  135  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  33.98 
 
 
234 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  38.17 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  40.08 
 
 
230 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
232 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  39.17 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  34.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  38.14 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  33.17 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  36.45 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.28 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  36.02 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.49 
 
 
247 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  36.82 
 
 
230 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 
220 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 
230 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 
223 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.99 
 
 
245 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 
237 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
237 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
237 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 
229 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
252 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 
221 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  35.44 
 
 
291 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  36.59 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  32.13 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  32.17 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
296 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.14 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
295 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  39.35 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 
296 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  32.78 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  32.78 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.42 
 
 
227 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
291 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
275 aa  89  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>