287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0137 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5888  putative carboxymethylenebutenolidase(dienelactone hydrolase  52.38 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284231  normal  0.610452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  40.47 
 
 
223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  38.07 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  37.21 
 
 
223 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  39.44 
 
 
227 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  44.05 
 
 
230 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  35.91 
 
 
221 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  38.22 
 
 
229 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  38.79 
 
 
229 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  39.63 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  38.12 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
229 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  37.33 
 
 
229 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  37.33 
 
 
229 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 
408 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3568  putative dienelactone hydrolase  34.84 
 
 
224 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 
223 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  31.05 
 
 
409 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 
407 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 
232 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 
231 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  33.68 
 
 
191 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2906  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
220 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 
433 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  36.2 
 
 
236 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  34.08 
 
 
407 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
230 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
230 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  36.79 
 
 
230 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 
230 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 
232 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 
230 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.3 
 
 
230 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
230 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  30.66 
 
 
413 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
233 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  31.13 
 
 
413 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  32.74 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
411 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  31.31 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 
227 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  29.21 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  30.81 
 
 
420 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  30.95 
 
 
410 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
232 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 
415 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  32.99 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  31.14 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
415 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
415 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 
236 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
240 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
415 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  28.21 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  28.21 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  28.21 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  30.18 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.02 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
409 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  28.02 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.84 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  28.02 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  26.58 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  26.58 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  26.12 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  26.58 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.59 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  25.71 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  30.61 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.82 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.41 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  28.64 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  25.96 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.7 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.7 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>