More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2080 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 235 aa  470  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  43.61 
 
 		 411 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  45.87 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  47.03 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  42.41 
 
 		 420 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  40.19 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  45.21 
 
 		 415 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  42.73 
 
 		 409 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  44.29 
 
 		 415 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  44.29 
 
 		 415 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 		 433 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  45.66 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  40.83 
 
 		 407 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  40.53 
 
 		 410 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  42.01 
 
 		 415 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  41.44 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  39.65 
 
 		 407 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  42.92 
 
 		 409 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  42.92 
 
 		 409 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  41.74 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  39.65 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  37.67 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  40.91 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  41.52 
 
 		 408 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  39.53 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  39.62 
 
 		 413 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  39.15 
 
 		 413 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  39.55 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  40.45 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  40.99 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  38.36 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  39.09 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  39.09 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  39.29 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  41.18 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  38.64 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  37.18 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  38.77 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  41.44 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  38.43 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  41.05 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  37.8 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  38.05 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.97 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  37.12 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  37.62 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  33.79 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  35.43 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  36.52 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  34.53 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  36.09 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  36.09 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  35.24 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  34.2 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  35.96 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 295 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  33.49 
 
 		 300 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  38.77 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.03 
 
 		 291 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30.3 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  34.48 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  31.06 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  36.45 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 290 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  30.74 
 
 		 290 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  33.19 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  35.15 
 
 		 191 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  30.3 
 
 		 290 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  35.15 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27.43 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  31.36 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>