More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2733 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
290 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  58.39 
 
 
291 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  56.93 
 
 
291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  56.57 
 
 
291 aa  325  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  56.78 
 
 
291 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  56.2 
 
 
291 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  53.96 
 
 
280 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  53.28 
 
 
278 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  53.31 
 
 
291 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  51.46 
 
 
275 aa  289  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  50.18 
 
 
293 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  49.1 
 
 
294 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  51.93 
 
 
290 aa  278  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  49.46 
 
 
290 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  50.9 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  51.64 
 
 
295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  49.3 
 
 
300 aa  271  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  49.46 
 
 
290 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  49.82 
 
 
291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  53.58 
 
 
270 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
291 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
291 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
291 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  48.04 
 
 
292 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
339 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  49.81 
 
 
278 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 
339 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  49.63 
 
 
275 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  48.04 
 
 
292 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  48.56 
 
 
291 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  45.56 
 
 
277 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  45.96 
 
 
290 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  49.82 
 
 
302 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  48.86 
 
 
275 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  51.6 
 
 
268 aa  261  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  49.44 
 
 
290 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  49.44 
 
 
290 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  49.44 
 
 
290 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  50.36 
 
 
298 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  49.61 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  48.66 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  46.45 
 
 
275 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  46.62 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  46.42 
 
 
271 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  46.42 
 
 
271 aa  251  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  46.24 
 
 
269 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  46.24 
 
 
267 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  46.42 
 
 
271 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  46.42 
 
 
271 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  46.42 
 
 
271 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  46.76 
 
 
291 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  45.32 
 
 
291 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  48.55 
 
 
297 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  48.55 
 
 
297 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  44.96 
 
 
291 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  45.66 
 
 
270 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  44.6 
 
 
291 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  47.46 
 
 
299 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  44.6 
 
 
291 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  44.6 
 
 
291 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  44.6 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  45.69 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  45.36 
 
 
307 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  48.19 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  43.86 
 
 
291 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 
248 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.94 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.18 
 
 
261 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 
245 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.87 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 
251 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  39.08 
 
 
223 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  36.32 
 
 
242 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
242 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30.12 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  35.44 
 
 
239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.32 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  30.52 
 
 
247 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 
223 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  35.34 
 
 
246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
250 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  37.85 
 
 
313 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 
244 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  35.15 
 
 
227 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  38.89 
 
 
238 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
232 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  36.58 
 
 
296 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 
291 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 
232 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  33.96 
 
 
254 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  35.04 
 
 
230 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  35.04 
 
 
230 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  35.04 
 
 
230 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>