More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5221 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  62.59 
 
 		 287 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  54.89 
 
 		 291 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  54.89 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  52.04 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  53.73 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  51.5 
 
 		 275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  53.36 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  52.99 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  53.73 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  55.26 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  53.9 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  52.79 
 
 		 302 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  50.38 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  49.44 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  49.04 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  52.61 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  52.8 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  50.19 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  53.58 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  47.96 
 
 		 294 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  49.43 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  47.21 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  46.84 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  49.25 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  47.96 
 
 		 290 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  48.83 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  51.19 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  49.81 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  49.81 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  48.29 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  47.23 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  47.58 
 
 		 290 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  47.23 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  46.64 
 
 		 290 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  48.66 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  48.47 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  48.66 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  49.04 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  48.66 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  48.66 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  48.47 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  48.47 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  48.45 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  46.82 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  49.81 
 
 		 299 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  46.13 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  46.86 
 
 		 291 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  47.01 
 
 		 291 aa  241  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  46.44 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  46.13 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  46.44 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  44.49 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  47.76 
 
 		 291 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  47.76 
 
 		 291 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  47.76 
 
 		 291 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  47.76 
 
 		 291 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  47.45 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  47.51 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  45.05 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  46.64 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  38.55 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  35.06 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.12 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  38.16 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  38.6 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  40.53 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.57 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  36.1 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  33.46 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  34.22 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  34.22 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  31.08 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  36.28 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  36.28 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.92 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  36.28 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  36.28 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.88 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  35.84 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  37.44 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  35.68 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  34.39 
 
 		 214 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  32.66 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  34.06 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>