More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3653 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  95.88 
 
 
291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  94.16 
 
 
291 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  93.47 
 
 
291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  92.78 
 
 
291 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  78.35 
 
 
339 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  78.69 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  78.35 
 
 
290 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  75.78 
 
 
256 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  65.52 
 
 
290 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  64.83 
 
 
294 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  63.79 
 
 
290 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  61.94 
 
 
293 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  59.66 
 
 
292 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  60 
 
 
292 aa  361  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  58.62 
 
 
291 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  58.08 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  57.24 
 
 
290 aa  329  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
302 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  56.12 
 
 
278 aa  315  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  55.28 
 
 
295 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  54.15 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  53.98 
 
 
291 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  52.67 
 
 
280 aa  304  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  51.74 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  52.56 
 
 
299 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  49.83 
 
 
291 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  50.35 
 
 
291 aa  298  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
291 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  48.29 
 
 
291 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  53.06 
 
 
297 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  53.06 
 
 
297 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  50.94 
 
 
278 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  50.95 
 
 
275 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  51.25 
 
 
300 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  52.54 
 
 
298 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  50.57 
 
 
275 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  50.18 
 
 
307 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  50.95 
 
 
268 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  47.64 
 
 
277 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  49.62 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  50.38 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  50.38 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  50.38 
 
 
275 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  50.57 
 
 
269 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  50.76 
 
 
271 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  50.57 
 
 
267 aa  271  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  50.57 
 
 
269 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  50.38 
 
 
271 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  50.38 
 
 
271 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  49.82 
 
 
290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  50.38 
 
 
291 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  50.38 
 
 
291 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  50.38 
 
 
291 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  50.38 
 
 
291 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  49.46 
 
 
290 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  51.23 
 
 
291 aa  268  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  49.46 
 
 
290 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  49.24 
 
 
270 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  46.13 
 
 
270 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  44.6 
 
 
290 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  41.52 
 
 
287 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  32.7 
 
 
261 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.27 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 
239 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  33.2 
 
 
246 aa  119  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
251 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.48 
 
 
295 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  34.7 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.31 
 
 
248 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 
214 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  32.75 
 
 
242 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  32.75 
 
 
242 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  30.48 
 
 
295 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 
295 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  37.26 
 
 
303 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  37.26 
 
 
303 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  37.26 
 
 
322 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 
295 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
313 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.03 
 
 
296 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 
295 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 
246 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  30.69 
 
 
297 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
295 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
291 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.1 
 
 
227 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.12 
 
 
248 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.31 
 
 
296 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.16 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  27.59 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>