More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6635 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  96.27 
 
 
295 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  80.61 
 
 
295 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  82.71 
 
 
295 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  77.97 
 
 
295 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  76.61 
 
 
295 aa  477  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  76.61 
 
 
295 aa  477  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  76.27 
 
 
295 aa  474  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  80.27 
 
 
295 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  77.63 
 
 
295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  75.98 
 
 
254 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  61.9 
 
 
294 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  61.09 
 
 
296 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  57.82 
 
 
295 aa  374  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  56.61 
 
 
295 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  56.8 
 
 
295 aa  362  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  56.51 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  55.74 
 
 
307 aa  338  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  55.1 
 
 
296 aa  338  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  54.42 
 
 
299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  52.22 
 
 
298 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  57.63 
 
 
296 aa  328  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  52.78 
 
 
305 aa  321  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  53.24 
 
 
303 aa  318  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  52.6 
 
 
305 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  49.68 
 
 
320 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  48.81 
 
 
296 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  50.49 
 
 
320 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  50.16 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  49.84 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  48.71 
 
 
326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  48.39 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  48.06 
 
 
326 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  47.42 
 
 
326 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  47.44 
 
 
331 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  52.41 
 
 
310 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  48.61 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  46.08 
 
 
291 aa  251  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  44.41 
 
 
295 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  75.54 
 
 
145 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  74.26 
 
 
136 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  39.8 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  78.26 
 
 
116 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  42.15 
 
 
324 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  38.82 
 
 
313 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  32.21 
 
 
303 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  32.21 
 
 
303 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.22 
 
 
227 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  31.89 
 
 
305 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 
278 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  35.27 
 
 
263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  39.5 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  35.53 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  36.45 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 
291 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
290 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  33.57 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  31.02 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  32.84 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  37.74 
 
 
298 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32.54 
 
 
271 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
275 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
291 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 
271 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.54 
 
 
269 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
291 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
291 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
291 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
291 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.87 
 
 
267 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  30.86 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.14 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.39 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.14 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 
268 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.14 
 
 
271 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.5 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
234 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 
254 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 
224 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  37.17 
 
 
232 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 
224 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  29.5 
 
 
290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 
291 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  34.75 
 
 
235 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>