More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0900 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  54.55 
 
 
220 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  45.95 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  43.24 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  47.3 
 
 
222 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  42.92 
 
 
229 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  41.92 
 
 
229 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  41.48 
 
 
229 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  42.61 
 
 
230 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  41.48 
 
 
229 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  41.48 
 
 
229 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 
229 aa  161  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  42.57 
 
 
230 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 
230 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  41.58 
 
 
230 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  41.58 
 
 
230 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 
230 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  41.58 
 
 
230 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
230 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  38.02 
 
 
229 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  39.6 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  37.81 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  35.91 
 
 
252 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  38.89 
 
 
236 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  40.59 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  40.59 
 
 
232 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  38.01 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  38.66 
 
 
191 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 
407 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  36.63 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  36.12 
 
 
409 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0706  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  38 
 
 
237 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  34.43 
 
 
251 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  34.51 
 
 
410 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 
420 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 
248 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  33.93 
 
 
407 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.29 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  35.21 
 
 
411 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.81 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  34.8 
 
 
413 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
409 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
409 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
433 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  34.36 
 
 
413 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  34.07 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0705  dienelactone hydrolase  38.27 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 
408 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
415 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.18 
 
 
246 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  35.81 
 
 
236 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  33.65 
 
 
275 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 
415 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
300 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
415 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 
245 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
415 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
275 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.01 
 
 
248 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  31.6 
 
 
290 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
290 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 
234 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  31.13 
 
 
290 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  31.46 
 
 
291 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  31.93 
 
 
291 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  31.93 
 
 
291 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  31.93 
 
 
291 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  31.93 
 
 
291 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.95 
 
 
275 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.39 
 
 
269 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
271 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.39 
 
 
269 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.39 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
271 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
268 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 
307 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  32.71 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  31.63 
 
 
294 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32.7 
 
 
271 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  30.87 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 
278 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>