More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3288 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
307 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  63.4 
 
 
305 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  63.43 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  65.17 
 
 
296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  61.92 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  61.92 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  62.58 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  62.58 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  62.09 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  61.02 
 
 
320 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  59.31 
 
 
331 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  60.7 
 
 
320 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  60.7 
 
 
320 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  56.23 
 
 
295 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  54.92 
 
 
295 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  54.92 
 
 
295 aa  332  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  54.92 
 
 
295 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  54.58 
 
 
295 aa  328  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  55.74 
 
 
295 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  55.93 
 
 
295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  53.04 
 
 
295 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  54.39 
 
 
295 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  52.19 
 
 
295 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  51.01 
 
 
295 aa  302  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  51.86 
 
 
295 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 
298 aa  300  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  50.53 
 
 
296 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  56.85 
 
 
254 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  49.48 
 
 
295 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  47.97 
 
 
297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  48.65 
 
 
294 aa  288  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  48.98 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  49.66 
 
 
299 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  49.16 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  47.96 
 
 
303 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  48.39 
 
 
310 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  46.21 
 
 
291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  42.71 
 
 
291 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  42.27 
 
 
295 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  40.99 
 
 
293 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  56.52 
 
 
145 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  67.29 
 
 
116 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  40.08 
 
 
324 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50.37 
 
 
136 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  36.94 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 
227 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
232 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 
235 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  33.19 
 
 
241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
232 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 
243 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  34.45 
 
 
235 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
236 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
230 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  35.86 
 
 
224 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  32.56 
 
 
232 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  32.17 
 
 
230 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
230 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  34.45 
 
 
230 aa  99  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.3 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 
230 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.27 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.54 
 
 
251 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 
224 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
227 aa  97.1  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 
420 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  34.69 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  31.03 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  29.78 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 
237 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 
237 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  31.93 
 
 
238 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  31.93 
 
 
238 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  36.63 
 
 
228 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 
237 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
280 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.87 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 
237 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.55 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.27 
 
 
248 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  30.58 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 
231 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 
224 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>