More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4117 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  84.45 
 
 		 238 aa  424  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  84.45 
 
 		 238 aa  424  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  76.92 
 
 		 235 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  75.85 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  76.07 
 
 		 235 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  74.79 
 
 		 237 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  75.53 
 
 		 237 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  74.26 
 
 		 237 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  75.11 
 
 		 237 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  75 
 
 		 236 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  77.63 
 
 		 230 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  74.26 
 
 		 237 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  75.11 
 
 		 237 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  65.94 
 
 		 234 aa  321  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  60.79 
 
 		 227 aa  285  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  46.96 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  46.75 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  46.55 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  42.22 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  39.32 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  41.53 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  39.74 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  38.12 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  35.62 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  35.43 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 		 291 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  34.05 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 292 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.09 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.65 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  34.53 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 295 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  35.19 
 
 		 296 aa  98.6  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 		 307 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 		 407 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  32.19 
 
 		 295 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  32.2 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  32.2 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  31.76 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.08 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.2 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 297 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.34 
 
 		 407 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  30.6 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 		 300 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  35.82 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  34.33 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  32.66 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  30.6 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  30.74 
 
 		 298 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  33.84 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  34.17 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  30.99 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 293 aa  89  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 295 aa  88.6  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  30.45 
 
 		 273 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 		 409 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.1 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.18 
 
 		 410 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 		 409 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 296 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 415 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  30.96 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 287 aa  85.5  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 		 291 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>