More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0965 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  98.77 
 
 
326 aa  666    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  99.08 
 
 
326 aa  668    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  100 
 
 
326 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  99.08 
 
 
326 aa  668    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  88.89 
 
 
320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  85.99 
 
 
320 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  87.91 
 
 
320 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  85.35 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  80.36 
 
 
331 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  69.74 
 
 
305 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  67.09 
 
 
305 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  61.94 
 
 
296 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  62.58 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  52.9 
 
 
295 aa  325  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  52.65 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  52.65 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  52.65 
 
 
295 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  50.32 
 
 
295 aa  315  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  50.33 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  48.71 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  48.55 
 
 
295 aa  302  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  48.2 
 
 
298 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  48.71 
 
 
295 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  48.39 
 
 
295 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  48.49 
 
 
295 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  50.5 
 
 
295 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  52.42 
 
 
254 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  48.48 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  46.47 
 
 
296 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  47.23 
 
 
303 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  47.74 
 
 
295 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  46.1 
 
 
295 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  44.05 
 
 
299 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  44.87 
 
 
296 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  45.79 
 
 
294 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  47.13 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  40.92 
 
 
291 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  39.27 
 
 
291 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  38.78 
 
 
295 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  36.72 
 
 
293 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  53.1 
 
 
145 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  33.03 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50.37 
 
 
136 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  55.81 
 
 
116 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
227 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 
248 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 
278 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 
246 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  32.69 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  36.68 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  34.31 
 
 
276 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  30.32 
 
 
241 aa  96.3  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  29.37 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  32.43 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  32.43 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  31.5 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  32.09 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  31.5 
 
 
290 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.53 
 
 
251 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
292 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
232 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  33.5 
 
 
227 aa  93.6  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
251 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
243 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
250 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  31.19 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 
257 aa  92.4  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 
230 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  27.98 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  36.5 
 
 
224 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  35.96 
 
 
222 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  29.95 
 
 
232 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 
232 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  26.59 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 
275 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  30.68 
 
 
235 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
230 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  28.17 
 
 
230 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
230 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 
214 aa  89  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  32.26 
 
 
223 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.09 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.34 
 
 
223 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  32.09 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  32.85 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 
302 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  31.1 
 
 
297 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>