More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02824 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  100 
 
 
254 aa  287  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  99.26 
 
 
295 aa  286  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  99.26 
 
 
295 aa  286  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  285  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  98.53 
 
 
295 aa  283  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  84.56 
 
 
295 aa  250  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  72.59 
 
 
295 aa  216  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  75.74 
 
 
295 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  71.32 
 
 
295 aa  206  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  75 
 
 
295 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  65.44 
 
 
296 aa  196  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  74.26 
 
 
295 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  73.33 
 
 
295 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  61.03 
 
 
294 aa  189  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  61.76 
 
 
297 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  60.9 
 
 
295 aa  184  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  61.03 
 
 
295 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  56.62 
 
 
295 aa  174  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  58.52 
 
 
296 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  54.81 
 
 
299 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  54.41 
 
 
320 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  54.07 
 
 
320 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  53.68 
 
 
320 aa  153  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  52.63 
 
 
296 aa  152  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  50.74 
 
 
296 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  52.94 
 
 
320 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
298 aa  151  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  51.85 
 
 
331 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  50.37 
 
 
326 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  50.37 
 
 
326 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  49.63 
 
 
326 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  49.63 
 
 
326 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
303 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  50.37 
 
 
307 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  48.15 
 
 
305 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  45.59 
 
 
305 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  48.87 
 
 
291 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  48.12 
 
 
291 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  47.45 
 
 
295 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  48.51 
 
 
324 aa  126  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  51.11 
 
 
310 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  41.91 
 
 
293 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  49.49 
 
 
313 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  41.86 
 
 
305 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  36.09 
 
 
250 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  41.67 
 
 
318 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  37.86 
 
 
227 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  41.88 
 
 
222 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  38.97 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  34.78 
 
 
407 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 
263 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  36.57 
 
 
273 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.5 
 
 
223 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  37.21 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  37.21 
 
 
303 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  37.21 
 
 
303 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  35.9 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.79 
 
 
278 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  33.58 
 
 
409 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  40.98 
 
 
224 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  35.86 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
407 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  33.58 
 
 
415 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  33.58 
 
 
415 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  35.2 
 
 
275 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 
420 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 
433 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
264 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  41.67 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  33.33 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  33.59 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  32.12 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  33.58 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  32.14 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
271 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 
275 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  37.01 
 
 
275 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.39 
 
 
409 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 
271 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.54 
 
 
271 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  38.84 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.54 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.81 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  38.52 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.39 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.54 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.54 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  35.14 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.54 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  33.1 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  39.34 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>