More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0207 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 296 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  64.14 
 
 		 320 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  66.55 
 
 		 305 aa  407  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  65.97 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  65.17 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  63.91 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  63.58 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  61.94 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  62.91 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  61.61 
 
 		 326 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  61.29 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  61.29 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  61.84 
 
 		 331 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  51.35 
 
 		 295 aa  322  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  51.35 
 
 		 295 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  51.69 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  51.01 
 
 		 295 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  49.83 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  50.34 
 
 		 295 aa  311  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  48.48 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  50.53 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  49.66 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  49.49 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  50 
 
 		 295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  49.15 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  48.14 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  48.81 
 
 		 295 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  48.82 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  46.44 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  46.46 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  54.47 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  48.81 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  46.81 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  49.83 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  45.61 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  47.74 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  41.67 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  40.14 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  39.24 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  37.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50.74 
 
 		 136 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  51.08 
 
 		 145 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  37.99 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  60.95 
 
 		 116 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  36.61 
 
 		 227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  35.4 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  35.51 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  35.51 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  30.87 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.36 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  33.95 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  32.57 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  35.29 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  35.5 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  29.67 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.63 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  28.52 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.38 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.38 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.74 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.38 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  36.57 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 232 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  30.73 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  30.73 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 		 230 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 		 236 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.93 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  29.44 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28.08 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  32.22 
 
 		 270 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  29.97 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.93 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 		 248 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>