More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1276 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  62.83 
 
 		 230 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  58.15 
 
 		 235 aa  287  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  60.79 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  60.79 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  59.91 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  59.91 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  57.27 
 
 		 235 aa  277  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  58.77 
 
 		 236 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  55.07 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  55.95 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  55.07 
 
 		 237 aa  257  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  55.07 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  55.75 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  55.31 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  55.31 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  53.54 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  50.88 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  47.6 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  47.37 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  46.49 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  46.05 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  45.37 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  43.75 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  40.18 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 		 243 aa  144  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  39.45 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  37.17 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  35.87 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  35.5 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  36.05 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.07 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  35.5 
 
 		 290 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  34.76 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  35.78 
 
 		 291 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  32.96 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 		 291 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  32.19 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 		 257 aa  101  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 		 407 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  35.32 
 
 		 296 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  31.54 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  32.55 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  30.6 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  30.53 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 		 407 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  34.31 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 296 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  31.36 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.2 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.43 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  31.74 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 263 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.1 
 
 		 291 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 275 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.75 
 
 		 295 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.75 
 
 		 295 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 		 263 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  34.32 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  32.47 
 
 		 296 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  33.33 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.33 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  32.74 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  30.99 
 
 		 291 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 		 291 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  33.91 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  30.13 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  32.59 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>