More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1677 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  95.42 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  77.57 
 
 		 263 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  71.76 
 
 		 263 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  71.76 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  71.37 
 
 		 265 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  70.99 
 
 		 263 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  63.74 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  61.6 
 
 		 261 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  67.77 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  50.38 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  53.15 
 
 		 318 aa  254  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  51.63 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  49.8 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  46.74 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  46.99 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  48.26 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  46.74 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  45.17 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  46.12 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  46.37 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  42.31 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  43.82 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  43.4 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  43.25 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  41.73 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  43.33 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  40.5 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  42.28 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  41.6 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  40.08 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  42.45 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  40.16 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  38.89 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  39.57 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  38.25 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  38.84 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  39.57 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  36.03 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  38.08 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  38.27 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  34.82 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  35.47 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  33.74 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  37.3 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  36.44 
 
 		 356 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  37.65 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  37.95 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.02 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  38.43 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  36.48 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  38.62 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  36.99 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  33.74 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  39 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  36.18 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  34.1 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  33.47 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  34.56 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  33.8 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  33.8 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  32.66 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  32.77 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  34.69 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  34.16 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  37 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  35.32 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  32.97 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  32.35 
 
 		 237 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  29.12 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  31.93 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  31.38 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 227 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  30.96 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  30.96 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 224 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.56 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.56 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.56 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>