More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3354 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 295 aa  610  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  79.93 
 
 		 295 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  80.61 
 
 		 295 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  80.76 
 
 		 297 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  69.28 
 
 		 298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  56.21 
 
 		 296 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  57.82 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  54.76 
 
 		 295 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  54.24 
 
 		 295 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  54.42 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  54.42 
 
 		 295 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  54.08 
 
 		 295 aa  346  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  55.44 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  58.16 
 
 		 295 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  53.06 
 
 		 296 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  53.9 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  53.23 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  52.9 
 
 		 326 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  55.1 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  49.66 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  52.58 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  52.58 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  50.34 
 
 		 294 aa  322  3e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  53.74 
 
 		 295 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  50.8 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  52.3 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  52.3 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  49.83 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  51.48 
 
 		 320 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  50.34 
 
 		 296 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  52.19 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  50.16 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  52.43 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  51.92 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  54.94 
 
 		 254 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  48.63 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  46.58 
 
 		 291 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  47.39 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 		 310 aa  254  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  42.32 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  60.9 
 
 		 136 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  41.6 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  38.54 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  46.76 
 
 		 145 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  50.88 
 
 		 116 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  31.97 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  36.64 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  31.53 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  31.53 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  33.86 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  32.45 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.23 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  38.18 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  36.06 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  36.06 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  30.31 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.32 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  34.8 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  34.39 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  29.55 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.1 
 
 		 251 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  33.76 
 
 		 409 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  36.09 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 232 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 409 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.33 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  39.55 
 
 		 214 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  30.69 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  28.42 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  29.26 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  28.42 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>