241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02825 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  100 
 
 
254 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  236  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  99.14 
 
 
295 aa  234  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  99.14 
 
 
295 aa  234  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  97.41 
 
 
295 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  83.62 
 
 
295 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  82.61 
 
 
295 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  80 
 
 
295 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  96.94 
 
 
145 aa  191  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  79.31 
 
 
295 aa  190  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  78.26 
 
 
295 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  78.26 
 
 
295 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  77.39 
 
 
295 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  64.91 
 
 
305 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  67.29 
 
 
307 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  61.21 
 
 
296 aa  153  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  63.16 
 
 
305 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  56.59 
 
 
320 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  60 
 
 
294 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  54.2 
 
 
331 aa  140  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  55.81 
 
 
326 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  55.81 
 
 
326 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  55.81 
 
 
320 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  57.5 
 
 
320 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  54.2 
 
 
326 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  55.04 
 
 
320 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  60.95 
 
 
296 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  53.49 
 
 
326 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  53.51 
 
 
296 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  54.46 
 
 
298 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  56.19 
 
 
296 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  57.28 
 
 
310 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  54.39 
 
 
295 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  50.88 
 
 
295 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  52.68 
 
 
297 aa  123  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  52.68 
 
 
295 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  51.75 
 
 
299 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  57.69 
 
 
291 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  48.7 
 
 
303 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  55.43 
 
 
291 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  46.15 
 
 
295 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  47.25 
 
 
293 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  51.9 
 
 
313 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  60 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
238 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
238 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
237 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
230 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  51.67 
 
 
237 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  46.67 
 
 
235 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  51.67 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 
237 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
237 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  50 
 
 
237 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  51.67 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  46.67 
 
 
235 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  38.37 
 
 
291 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  51.67 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  48.33 
 
 
238 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  48.33 
 
 
238 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  49.12 
 
 
262 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  50.91 
 
 
261 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  47.06 
 
 
264 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  36.67 
 
 
290 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  42.86 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  45.45 
 
 
275 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  41.67 
 
 
230 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  52.17 
 
 
278 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  39.19 
 
 
273 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  37.21 
 
 
290 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  41.82 
 
 
290 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  41.82 
 
 
290 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  41.82 
 
 
290 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  43.75 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  37.8 
 
 
254 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  43.48 
 
 
245 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  41.56 
 
 
275 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  38.3 
 
 
230 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  40 
 
 
305 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  41.67 
 
 
232 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
230 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
230 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  40.96 
 
 
232 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  37.23 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  45.31 
 
 
227 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  46.3 
 
 
246 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  42.42 
 
 
275 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  40.62 
 
 
420 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  42.19 
 
 
227 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  36 
 
 
269 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  36 
 
 
271 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  36 
 
 
271 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  46.67 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>