More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3378 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  99.08 
 
 
326 aa  668    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  99.08 
 
 
326 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  100 
 
 
326 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  98.16 
 
 
326 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  87.91 
 
 
320 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  85.03 
 
 
320 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  86.93 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  84.39 
 
 
320 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  79.46 
 
 
331 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  68.75 
 
 
305 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  66.46 
 
 
305 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  61.92 
 
 
307 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  61.29 
 
 
296 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  53.23 
 
 
295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  51.66 
 
 
295 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  51.66 
 
 
295 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  51.66 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  49.35 
 
 
295 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  49.35 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  50.65 
 
 
297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  48.87 
 
 
295 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  48.85 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  48.39 
 
 
295 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  48.16 
 
 
295 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  47.42 
 
 
295 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  47.81 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  49.5 
 
 
295 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  51.3 
 
 
254 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 
296 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  46.25 
 
 
303 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  46.77 
 
 
295 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  45.13 
 
 
295 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  43.09 
 
 
299 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  45.12 
 
 
294 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  44.23 
 
 
296 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2322  carboxymethylenebutenolidase  46.5 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  40.26 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  38.61 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  38.78 
 
 
295 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.73 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02824  hypothetical protein  50.37 
 
 
136 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3428  carboxymethylenebutenolidase  51.03 
 
 
145 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02825  hypothetical protein  53.49 
 
 
116 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  34.89 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  33.5 
 
 
227 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 
248 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  37.19 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  31.94 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
246 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  31.73 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  28.71 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  29.6 
 
 
241 aa  95.5  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.84 
 
 
251 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  31.88 
 
 
230 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
250 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  30.98 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  30.87 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  30.87 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
290 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 
292 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
243 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  29.47 
 
 
232 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  36.45 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.65 
 
 
251 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  26.98 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
230 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
230 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 
230 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 
227 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  31.08 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
257 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
224 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  29.47 
 
 
230 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
232 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.34 
 
 
223 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.13 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  31.8 
 
 
223 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.83 
 
 
214 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
230 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  28.37 
 
 
232 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  29.47 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 
248 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.08 
 
 
410 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  30.68 
 
 
235 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
236 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  32.04 
 
 
234 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.09 
 
 
409 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  29.3 
 
 
237 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>