More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3842 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  35.18 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  32.89 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  40.7 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  32.31 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  32.46 
 
 		 254 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.48 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  39.5 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.35 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  33.81 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.09 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  32.1 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  30.08 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  37.56 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  37.56 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  31.33 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 		 251 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  35 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  34.31 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  29.44 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  29.88 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  35 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  31.12 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 290 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  34.31 
 
 		 326 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  28.06 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  34.44 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  30.51 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  31.07 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  31.54 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  31.54 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.03 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 326 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  29.06 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  38.19 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  30.5 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  38.19 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 		 408 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 320 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  32.68 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  29.74 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  30.54 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  29.06 
 
 		 291 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  30.85 
 
 		 232 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  29.39 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.74 
 
 		 227 aa  89  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.92 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  28.94 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  27.64 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  31.74 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>