More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1783 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
227 aa  463  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  50.66 
 
 
227 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  50.47 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  44.35 
 
 
224 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  44.35 
 
 
224 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  44.1 
 
 
224 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  47.03 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  41.74 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  44.07 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  39.17 
 
 
214 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  43.78 
 
 
228 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  45.33 
 
 
238 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  45.33 
 
 
238 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  43.75 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  40.71 
 
 
235 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  42.22 
 
 
238 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  42.22 
 
 
238 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 
235 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  40.43 
 
 
234 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  39.3 
 
 
228 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  39.56 
 
 
237 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  38.67 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  37.61 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  40.37 
 
 
296 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  36.7 
 
 
292 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  34.36 
 
 
290 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  34.36 
 
 
290 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  36.4 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 
291 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0898  dienelactone hydrolase  38.39 
 
 
228 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0905953  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  36.64 
 
 
295 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  37.77 
 
 
295 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  36.84 
 
 
318 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  37.05 
 
 
303 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  38.46 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  37.72 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  32.43 
 
 
263 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
291 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.08 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 
296 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  36.48 
 
 
295 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  34.33 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  36.48 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  37.56 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  36.48 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  36.05 
 
 
254 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  37.77 
 
 
295 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.62 
 
 
248 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  32.32 
 
 
257 aa  108  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 
296 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  35.93 
 
 
240 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  34.63 
 
 
295 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
278 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  39.91 
 
 
295 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  34.76 
 
 
297 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  32.97 
 
 
273 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  38.3 
 
 
295 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 
223 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  32.1 
 
 
275 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  39.06 
 
 
295 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 
246 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  31.25 
 
 
290 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
247 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  35.06 
 
 
305 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  31.25 
 
 
290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
246 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  34.63 
 
 
320 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  35.92 
 
 
303 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  35.92 
 
 
303 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  37.18 
 
 
410 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 
322 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  34.56 
 
 
295 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 
263 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  30 
 
 
247 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  33.89 
 
 
409 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 
267 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  32.3 
 
 
263 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 
295 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
297 aa  98.6  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  34.58 
 
 
297 aa  98.6  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  34.21 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  34.03 
 
 
433 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.21 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 
407 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  33.82 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  34.5 
 
 
320 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
307 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 
232 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>