More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1285 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  56.08 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  50.98 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 		 295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  32.43 
 
 		 227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  32.45 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  35.14 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.22 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.83 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  32.96 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  32.95 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  31.95 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.92 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  27.72 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.21 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  34.2 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.08 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  30.45 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  28.9 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  31.4 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  31.4 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  30.22 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  29.85 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  32.2 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  34.22 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  27.47 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  28.84 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  29.85 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  29.32 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  29.48 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  30.62 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  28.62 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  29.48 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 298 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  29.48 
 
 		 237 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.54 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  29.74 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  29.74 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 291 aa  92  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  29.71 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.88 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.92 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.92 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.92 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  25.77 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  28.68 
 
 		 224 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  27.17 
 
 		 291 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  27.38 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.16 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.57 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  26.54 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  27.41 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>