More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1980 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  95.1 
 
 
245 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  73.88 
 
 
246 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  40.17 
 
 
263 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  41.42 
 
 
262 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  40.5 
 
 
262 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  41.08 
 
 
261 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  41.56 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  41.32 
 
 
262 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  40.5 
 
 
262 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  40.74 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  39.92 
 
 
265 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  39.09 
 
 
263 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  39.51 
 
 
263 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  36.29 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  40.67 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  36.44 
 
 
259 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  37.14 
 
 
263 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  36.29 
 
 
267 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  39.44 
 
 
260 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 
263 aa  154  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  35.32 
 
 
270 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  36.36 
 
 
318 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  32.2 
 
 
280 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  38.16 
 
 
264 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  38.39 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  34.25 
 
 
238 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  34.7 
 
 
238 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  35.11 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  36.45 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  33.75 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 
258 aa  131  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  31.65 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  36.65 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  30.7 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  30.7 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  35.24 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  32.62 
 
 
279 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  35.11 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 
241 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  39.36 
 
 
262 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32.13 
 
 
250 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  34.29 
 
 
234 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  34.88 
 
 
261 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  35.6 
 
 
244 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  31.78 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  30.48 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  32.78 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 
241 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  30.25 
 
 
263 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  31.69 
 
 
241 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 
242 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  31.12 
 
 
243 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  32.03 
 
 
356 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 
241 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  31.12 
 
 
243 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  33.65 
 
 
242 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
249 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
227 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  27.87 
 
 
261 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 
245 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
237 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 
234 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  25.82 
 
 
241 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.1 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  29.77 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  30.92 
 
 
275 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.56 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  29.48 
 
 
291 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  29.48 
 
 
291 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  29.48 
 
 
291 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  29.48 
 
 
291 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.9 
 
 
251 aa  88.6  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  34.3 
 
 
313 aa  88.6  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.03 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  27.65 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.97 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.14 
 
 
247 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  25.87 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
214 aa  86.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  32.78 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  26.05 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
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NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  28.97 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
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