217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4157 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  46.49 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  45.83 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  46.05 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  42.74 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  37.66 
 
 		 261 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  42.19 
 
 		 356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  42.19 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  41.77 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  40.62 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  37.82 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  36.51 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  38.96 
 
 		 269 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  41.35 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  36.1 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  41.6 
 
 		 263 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  39.67 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  36.1 
 
 		 263 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  36.25 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  35.51 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  35.86 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  36.6 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  39.57 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  37.45 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  35.34 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  34.84 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  38.1 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  35.22 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  38.26 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  38.26 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  39.13 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  36.02 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  34.31 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  38.7 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  38.26 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  38.26 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  35.96 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  35.96 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  41.52 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  36.02 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  35.59 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  34.85 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  37.18 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  36.09 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  34.31 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  35.19 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  33.77 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  34.6 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  32.89 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  35.48 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  34.07 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  32.61 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  34.14 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  34.14 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  34.14 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  32.37 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  30.8 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  29.07 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  36.75 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  36.19 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  32.62 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  37.26 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  32.08 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  34.45 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 		 296 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  29.61 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46214  predicted protein  27.87 
 
 		 367 aa  72  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.95 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.87 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.06 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.33 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.67 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.94 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.78 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.36 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.2 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  28.89 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  28.89 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  30.98 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  32.82 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>