More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2536 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  72.29 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  53.88 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  57.44 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  51.91 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  55.08 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  53.63 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  50.57 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  49.24 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  54.77 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  51.54 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  53.72 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  50.97 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  51.54 
 
 		 265 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  49.81 
 
 		 262 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  51.15 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  51.63 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  48.69 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  52.54 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  49.58 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  47.04 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  44.22 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  41.09 
 
 		 261 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  44.86 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  44.75 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  43.58 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  42.92 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  45.62 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  42.51 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  42.02 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  38.64 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  45.15 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  43.4 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  38.84 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  38.03 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  38.76 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  39.42 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  40.62 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  36.23 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  35.32 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  37.96 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  36.55 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  37.96 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  35.77 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  36.13 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  34.04 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.79 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  38.05 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37.04 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  38.11 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  38.66 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  41.99 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 		 242 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  39.26 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  33.88 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  36.18 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  40 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  40 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  35.11 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  34.83 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  34.22 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  41.56 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  37.18 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  39.17 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  37.83 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  39.5 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  36.02 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  34.01 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  34.57 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  34.3 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  39.39 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.21 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  34.11 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  31.42 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.03 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  30.23 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.85 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  28.37 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  31.19 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  31.19 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  31.19 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 		 251 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.63 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.13 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.45 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.46 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.48 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.65 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  30.88 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>