225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2775 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  61.6 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  51 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  51.25 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  51.67 
 
 		 241 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  51.25 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  50.83 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  54.2 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  54.2 
 
 		 241 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  50.42 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  48.33 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  48.33 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  48.73 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  46.25 
 
 		 261 aa  218  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  47.06 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  45.04 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  44.63 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  42.63 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  38.75 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  36.67 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  40.33 
 
 		 318 aa  161  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  42.26 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  40.85 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  38.46 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  37.65 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  37.76 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  34.48 
 
 		 238 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  34.48 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  37.96 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  41.35 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  39.64 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  36.13 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  35.29 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  38.96 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  36.97 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  38 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  37.94 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  36.97 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  38.79 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  36.76 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  38.5 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  37.15 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  36.36 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  36.1 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  38.79 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  36.95 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  34.94 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  39.17 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  34.14 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  36.55 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  34.55 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  36.86 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  34.35 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  36.6 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  33.6 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32.79 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  36.75 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  38.14 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  33.97 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  38.65 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  36.63 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.9 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  37.13 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  37.13 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  31.12 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  32.42 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  39.02 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  35.02 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  28.37 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  35.14 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  34.78 
 
 		 241 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  29.66 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  32.65 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.8 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.8 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.8 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.15 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.99 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46214  predicted protein  26.94 
 
 		 367 aa  65.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  23.32 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  24.18 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  29.2 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  34.09 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  34.09 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  27.52 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  34.09 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  34.09 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>