299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4178 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  97.93 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  96.68 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  95.02 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  72.8 
 
 		 242 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  72.61 
 
 		 242 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  70.71 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  67.08 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  66.67 
 
 		 241 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  51.67 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  51.26 
 
 		 269 aa  214  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  44.08 
 
 		 261 aa  205  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  45.89 
 
 		 261 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  44.26 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  44.29 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  43.81 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.15 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  41.15 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  39.02 
 
 		 246 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  38.17 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  38.33 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  38.49 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  37.71 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  39.44 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  38.86 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  40.19 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  34.17 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  39.23 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  39.5 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  38.39 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  35.98 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  35.68 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  39.62 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  34.15 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  36.18 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.49 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  37.07 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  33.49 
 
 		 262 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  39.71 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  31.17 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  38.26 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  32.86 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 261 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  34.16 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  31.51 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  33.18 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  40.09 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  33.8 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  33.8 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  32.72 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  33.03 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  32.72 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  28.11 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  29.39 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  29.3 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 		 356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  35.44 
 
 		 243 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  34.95 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  32.22 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  25.71 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  36.79 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  29.09 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  30.84 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  34.48 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  29.81 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.32 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.88 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  27.32 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  27 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.78 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.34 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.15 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  24.15 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.12 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  25.57 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>