More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  91.22 
 
 
262 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  69.92 
 
 
261 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  68.82 
 
 
263 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  65.78 
 
 
262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  65.4 
 
 
262 aa  351  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  64.12 
 
 
263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  64.89 
 
 
265 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  64.5 
 
 
263 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  63.36 
 
 
263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  54.62 
 
 
269 aa  278  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  53.01 
 
 
270 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  48.65 
 
 
263 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  52.16 
 
 
263 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  53.88 
 
 
318 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  48.66 
 
 
268 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  47.27 
 
 
267 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  47.37 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  46.33 
 
 
262 aa  228  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  45.53 
 
 
260 aa  225  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  46.3 
 
 
259 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  42.97 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  41.94 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  42.42 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  42.34 
 
 
264 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  37.35 
 
 
261 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  44.16 
 
 
280 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  40.91 
 
 
245 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  41.32 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  42.63 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  39.58 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  40.66 
 
 
239 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  41.74 
 
 
246 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  41.53 
 
 
279 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  38.7 
 
 
238 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  38.26 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  37.04 
 
 
258 aa  165  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  37.19 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  37.97 
 
 
237 aa  161  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  34.87 
 
 
261 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  42.17 
 
 
234 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  34.87 
 
 
238 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  36.21 
 
 
263 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  37.5 
 
 
356 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  39.48 
 
 
237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  37.72 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  38.02 
 
 
243 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37.61 
 
 
241 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  36.93 
 
 
243 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  34.29 
 
 
242 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  40.09 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  32.18 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  32.91 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 
242 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  37.99 
 
 
234 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  35.34 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  36.21 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  32.23 
 
 
242 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
241 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  35.48 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  35.54 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  36.96 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  35.93 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  34.48 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  34.91 
 
 
241 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  125  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 
265 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  37.67 
 
 
237 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 
254 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  32.27 
 
 
296 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  36.6 
 
 
269 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  32.58 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 
290 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 
256 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  31.46 
 
 
243 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.19 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  30.61 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  28.37 
 
 
214 aa  85.9  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 
227 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.45 
 
 
241 aa  85.5  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  34.6 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.28 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  29.75 
 
 
235 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  30.19 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.61 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>