More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0569 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  100 
 
 
267 aa  550  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  94.38 
 
 
265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  53.97 
 
 
245 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  41.85 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  38.13 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  36.13 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
241 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  32.49 
 
 
241 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  36.8 
 
 
264 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  35.02 
 
 
241 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  34.6 
 
 
241 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  32.07 
 
 
241 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  32.07 
 
 
241 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  32.5 
 
 
242 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
242 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  35.02 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  36.69 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  34.51 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  33.85 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  37.24 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  33.07 
 
 
260 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  31.89 
 
 
261 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  33.59 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  32.45 
 
 
269 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  32.82 
 
 
262 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  32.8 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  35.27 
 
 
259 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  33.46 
 
 
265 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  34.19 
 
 
262 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  33.08 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  33.19 
 
 
262 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  30.96 
 
 
237 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 
267 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  32.91 
 
 
237 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  29.92 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  32.08 
 
 
270 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  29.51 
 
 
273 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  32.19 
 
 
237 aa  115  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  32.18 
 
 
262 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  30.42 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  31.49 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  31.06 
 
 
238 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  31.03 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  31.71 
 
 
280 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  32.22 
 
 
246 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  33.97 
 
 
241 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  32.3 
 
 
234 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  26.14 
 
 
264 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 
264 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
269 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  29.66 
 
 
238 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  32.62 
 
 
234 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  27.43 
 
 
244 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  29.36 
 
 
246 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 
250 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  29.13 
 
 
257 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
292 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  27.12 
 
 
238 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
271 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.37 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  28.39 
 
 
356 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.56 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  27.85 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  28.39 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  28.39 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 
237 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  32.63 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  31.3 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  28.27 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.73 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  32.1 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  29.54 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  29.19 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  28.99 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  25.88 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  25.88 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  25.44 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  25 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  27.62 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  28.31 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>