249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7419 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  38.08 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  37.02 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  38.43 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  42.22 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.28 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  37.13 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  36 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  41.9 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  36 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  37.87 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  34.39 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  37.99 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  35.45 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  37.95 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  38.36 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  37.07 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  37.07 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  36.68 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  33.63 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  37.83 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  38.67 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  38.67 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  39.29 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  35.62 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  38.36 
 
 		 356 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  36.49 
 
 		 269 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  34.91 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  34.7 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.16 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  34.25 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  39.22 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  35.16 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  35.16 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  37.77 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  37.18 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  35.53 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  33.78 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  32.87 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  35.51 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  34.32 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  38.05 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  35.48 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  35.21 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  31.78 
 
 		 245 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  31.7 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  36.32 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  34.95 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 258 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  33.18 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32.21 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  36.94 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  37.25 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  36.49 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.44 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  34 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.3 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.74 
 
 		 265 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  37.21 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  35.98 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  34.88 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  40.21 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  34.15 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  34.8 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  31.42 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  33.66 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  33.17 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  41.12 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  30.41 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  24.14 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.75 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  28.02 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4961  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  29.48 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  26.84 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  24.27 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  30.05 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  28.12 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  27.36 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>