290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78962 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  62.28 
 
 
289 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  53.26 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  47.35 
 
 
248 aa  234  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  42.46 
 
 
244 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  40.71 
 
 
245 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  40.87 
 
 
245 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  40.32 
 
 
245 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  40.32 
 
 
245 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  40.87 
 
 
245 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  41.27 
 
 
244 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  40.32 
 
 
245 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  40.32 
 
 
245 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  40.32 
 
 
245 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  38.74 
 
 
245 aa  205  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  40.48 
 
 
245 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  39.92 
 
 
245 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  37.94 
 
 
245 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  41.27 
 
 
247 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  41.67 
 
 
245 aa  201  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  40.08 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  39.92 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  41.11 
 
 
245 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  40.48 
 
 
245 aa  194  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  35.83 
 
 
248 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  39.83 
 
 
245 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  39.24 
 
 
250 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  36.75 
 
 
246 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  36.32 
 
 
246 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  35.17 
 
 
246 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  37.85 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 
251 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 
248 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.31 
 
 
247 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.31 
 
 
247 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.52 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  25.21 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  26.36 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  25.45 
 
 
407 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  24.2 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.91 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  23.53 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  24.47 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  23.77 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.59 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  24.47 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  24.9 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  24.19 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  25.83 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  26.77 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  24.47 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  24.3 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  26.96 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  23.61 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  24.3 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  23.9 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  24.47 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  20.48 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  26.44 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  23.9 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  24.4 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  23.9 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  23.9 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  23.9 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
409 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  22.95 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  23.97 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  23.97 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  23.97 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  23.04 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  22.54 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  22.58 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  22.54 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  22.54 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  22.54 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  21.72 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  22.22 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  21.77 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  23.97 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  23.66 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  25.52 
 
 
413 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>