260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1544 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  100 
 
 		 245 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  68.85 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  69.26 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  69.26 
 
 		 245 aa  362  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  68.44 
 
 		 245 aa  360  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  67.62 
 
 		 245 aa  358  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  67.62 
 
 		 245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  348  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  64.75 
 
 		 245 aa  347  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  63.52 
 
 		 245 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  63.67 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  64.08 
 
 		 245 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  64.75 
 
 		 247 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  65.53 
 
 		 244 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  65.11 
 
 		 245 aa  338  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  54.51 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  53.33 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  70.18 
 
 		 172 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  42.26 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  40.08 
 
 		 269 aa  200  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  42.67 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  42.67 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  40.43 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  38.91 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  36.78 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  39.68 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  37.19 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.32 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  27.62 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 		 420 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  64.18 
 
 		 68 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  27.5 
 
 		 410 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  25.71 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 		 407 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.57 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 407 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.31 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  26.16 
 
 		 408 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.97 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  27.91 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  26.23 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  25.41 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.09 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  25.41 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  27.55 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  26.15 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  25.54 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  27.71 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  29.19 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  26.42 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  28.86 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  30.72 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  25.63 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  23.36 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 		 411 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 		 409 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  25.45 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  24.7 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  24.69 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  24.88 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.27 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  25.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  25.23 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  30.91 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  26.91 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.42 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  26.12 
 
 		 296 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  24.9 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  27.98 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  27.98 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  23.33 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>