More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1279 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  75.82 
 
 
250 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  71.43 
 
 
246 aa  380  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  64.75 
 
 
246 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  64.75 
 
 
246 aa  351  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  47.11 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  44.08 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  44.08 
 
 
245 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  44.08 
 
 
245 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  42.26 
 
 
245 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 
245 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 
245 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 
245 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  44.74 
 
 
244 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  40.65 
 
 
245 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  41.22 
 
 
245 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  40.82 
 
 
245 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  42.79 
 
 
245 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  43.61 
 
 
244 aa  198  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  41.18 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  41.06 
 
 
245 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  39.43 
 
 
245 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  38.37 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  39.02 
 
 
247 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  43.67 
 
 
248 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  39.57 
 
 
245 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  39.83 
 
 
269 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  37.6 
 
 
289 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  45.22 
 
 
172 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  35.95 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  35.25 
 
 
248 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
246 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.38 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 
248 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  31.98 
 
 
247 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 
247 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 
251 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 
244 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 
251 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
247 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  27.95 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  29.2 
 
 
413 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 
420 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  25.83 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  29.2 
 
 
413 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  28.07 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  30.05 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  25.79 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25.51 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25.51 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.92 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.54 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  27.75 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  26.42 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.54 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.73 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  25.31 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.48 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  26.48 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 
408 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  27.85 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  27.2 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  28.17 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  23.77 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  25.86 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  26.21 
 
 
232 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.15 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.81 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  26.96 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  23.2 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  27.82 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  24.4 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  21.05 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  25.9 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  27.09 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  27.57 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10371  dienelactone hydrolase  27.1 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  27.69 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
409 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  23.98 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>