More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0145 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  46.99 
 
 
287 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  44.89 
 
 
295 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  39.08 
 
 
245 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 
246 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 
246 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  36.82 
 
 
246 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
248 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  36.99 
 
 
249 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  36.09 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  35.15 
 
 
245 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 
246 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  32.39 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 
251 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  31.62 
 
 
270 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  27.17 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  28.75 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.48 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  32.68 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.08 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  27.83 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.09 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  29.75 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.99 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  27.13 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  28.82 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  29.58 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  25.93 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.11 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  25.93 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  25.82 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  27.48 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  25.31 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  27.86 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  27.47 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.6 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 
407 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.61 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  27.47 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  23.26 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  24.58 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.11 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.11 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.25 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  31.01 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  27.7 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.64 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  27.1 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.1 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.98 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  26.26 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  26.57 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  26.74 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  25.48 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  25.48 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  28.22 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  25.48 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  26.04 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  25.48 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  27.6 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  27.34 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  27.24 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  26.82 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  25.29 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.94 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2526  dienelactone hydrolase  24.71 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.94 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  27.03 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>