More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2499 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  99.56 
 
 
228 aa  460  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  67.26 
 
 
237 aa  329  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  44.02 
 
 
237 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  41.38 
 
 
252 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  45.07 
 
 
275 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  41.44 
 
 
245 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  37.27 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  39.64 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 
295 aa  95.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 
297 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 
296 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 
326 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.02 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 
326 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  30.62 
 
 
326 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
234 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  30.81 
 
 
320 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 
291 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 
290 aa  88.6  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  27.91 
 
 
250 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 
326 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 
320 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  30.62 
 
 
320 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  27.04 
 
 
298 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 
290 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  30.19 
 
 
295 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 
290 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  29.51 
 
 
254 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 
331 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  29.38 
 
 
295 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  29.38 
 
 
295 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  29.8 
 
 
291 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 
320 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  28.91 
 
 
254 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  27.89 
 
 
251 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  27.42 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  30.87 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  28.12 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.91 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  33.63 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.15 
 
 
290 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 
291 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  28 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28 
 
 
271 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  28 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.78 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.15 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  28 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.52 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.56 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  27.7 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  28.76 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  27.23 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.1 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  31.92 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  31.92 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  31.92 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  29.32 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  28.94 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  29.07 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  29.17 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  30 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  26.44 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  29.38 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.67 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
303 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  24.41 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.89 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  24.79 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  25.2 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  33.84 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  30.26 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  30.26 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>