More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3068 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  64.94 
 
 
249 aa  322  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  50.88 
 
 
237 aa  202  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  51.09 
 
 
252 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  45.81 
 
 
275 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  39.64 
 
 
237 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  39.64 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  39.64 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  39.64 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  34.76 
 
 
245 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  32.93 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  36.09 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  36.09 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  33.72 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 
291 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  34.63 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  34.63 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.9 
 
 
235 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  31.92 
 
 
303 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  32.46 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 
243 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 
254 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  34.85 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.05 
 
 
296 aa  85.5  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  29.54 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  32.46 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  31.3 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  31.3 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  28.06 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  30.25 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  29.86 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  32.81 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  25.29 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  31.16 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  28.08 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  29.92 
 
 
291 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  33.74 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  28.79 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  33.01 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  28.79 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  28.41 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  28.79 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  28.41 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.71 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.61 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  31.39 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  28.41 
 
 
271 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  30.93 
 
 
295 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  28.41 
 
 
271 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
408 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.03 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  27.97 
 
 
290 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  32.18 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 
290 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.98 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  25.66 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  28.52 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  26.78 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.8 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>