288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2943 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  44.44 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  43.78 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  45.13 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  41.44 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  45.54 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  45.81 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  45.07 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  45.07 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  38.24 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  25.95 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  33.5 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  32.81 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.48 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  33.85 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.53 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  32.39 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  32.6 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  27.43 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  31.68 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  36.11 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.01 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  30.6 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 		 415 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 		 415 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.44 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  29.26 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  32.3 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  32.3 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  30.22 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.28 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  28.8 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.56 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.73 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  29.09 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  26.8 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.02 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  28.44 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  22.87 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25.96 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  25.83 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  27.02 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  33.7 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  27.02 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  38.98 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  34.69 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  34.69 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  34.69 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  23.87 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  32.67 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  28.33 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  25.6 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  26.87 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  27.12 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  29.65 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.7 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  30.91 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  28.93 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  27.69 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  27.83 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  29.95 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  32.42 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  31.79 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.63 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>