More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2684 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 237 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  81.36 
 
 		 252 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  44.44 
 
 		 275 aa  208  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  46.43 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3068  dienelactone hydrolase  51.32 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  44.02 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  43.59 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  44.02 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  41.35 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  38.27 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  30.5 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  27.67 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  27.67 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.8 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  32.27 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 291 aa  85.1  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  25.18 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  33.99 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  28.03 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.07 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  29.64 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.27 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.06 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  30.45 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  27.1 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.36 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  32.94 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  32.94 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  36.71 
 
 		 409 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.6 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.2 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  28.35 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  34.45 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  26.8 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  26.8 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  26.8 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.2 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.51 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  33.9 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  33.9 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  33.9 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.2 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  29.17 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  27.17 
 
 		 339 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  29.35 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  27 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  26.59 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  26.59 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  26.59 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  26.59 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  23.77 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.77 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  26.77 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.9 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  27.53 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.8 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  27.24 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  31.65 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  31.65 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  28.04 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  28.12 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  28.14 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  25.41 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.5 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.86 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>