163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2269 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  38.39 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0053  dienelactone hydrolase  37.89 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  31.95 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  28.5 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  32.67 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  32.08 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  29.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  32.28 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  24.45 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  28.83 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  27.36 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 415 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  27.44 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.96 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  28.36 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  30.45 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25.84 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25.84 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  27.7 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  27.51 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  24.88 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  31.48 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  27.34 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 409 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2536  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  25.38 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2499  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  26.74 
 
 		 636 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2544  dienelactone hydrolase  28.36 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.55 
 
 		 751 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.81 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  26.04 
 
 		 429 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.03 
 
 		 635 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.12 
 
 		 642 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  33.1 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  23.44 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  30.93 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  25.94 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  28.64 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  27.49 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  34.48 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  28.4 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.82 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  34.21 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  34.21 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.82 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  26.44 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  25.53 
 
 		 423 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  33.62 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.46 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  30.89 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.89 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  23.96 
 
 		 425 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  27.15 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  23.39 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  31.01 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.13 
 
 		 698 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  28.42 
 
 		 320 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 291 aa  45.4  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  25.88 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  22.4 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  29.67 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  30.4 
 
 		 668 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  33.1 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  26.36 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  33.1 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  26.32 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.79 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>