More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4124 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  46.41 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  47.26 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4008  dienelactone hydrolase  46.12 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.0103051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2157  dienelactone hydrolase  45.57 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2098  dienelactone hydrolase  45.57 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2111  dienelactone hydrolase  45.57 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  40.43 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0598  dienelactone hydrolase  40.65 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  38.24 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  37.4 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  30.7 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  30.7 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  30.92 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  27.84 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.2 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.36 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  29.84 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 407 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  27.57 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.73 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  27.52 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  28.9 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  26.38 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  25.41 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  29.34 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  26.88 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  23.36 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  23.77 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  27.39 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.9 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.71 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  28.14 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  31.25 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  29.13 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  29.36 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  26.1 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  29.54 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  31.9 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  26.52 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  26.23 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  24.7 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  28.44 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  23.83 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  27.48 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.15 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  29.11 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.87 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  23.46 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  25.76 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  28.05 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  25.38 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  28.44 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.07 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  26.14 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  26.14 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  27.31 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  27.31 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  25.97 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  22.05 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  30.41 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  29.77 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  25.76 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  27.68 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>