289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3109 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  53.33 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  54.29 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  52.65 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  52.65 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  52.65 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  52.03 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  52.46 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  51.84 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  51.43 
 
 		 245 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  51.43 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  50.63 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  51.23 
 
 		 245 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  52.12 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  51.25 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  48.57 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  50.42 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  51.25 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  50.42 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  52.77 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  49.58 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  47.35 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  48.72 
 
 		 289 aa  231  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  46.44 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  44.58 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  43.67 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  43.23 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  42.92 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  43.4 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  51.46 
 
 		 172 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.49 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.05 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.07 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.77 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 		 407 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.58 
 
 		 420 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.38 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.02 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.02 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  31.62 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  28.69 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  31.2 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 407 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  29.03 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.3 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.45 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  28.38 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  27.95 
 
 		 413 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.65 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  29.79 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12778  hypothetical protein  28.34 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.5571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  27.49 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  29.47 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  27.98 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  31.63 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  26.15 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  29.15 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  27.52 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  27.66 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  27.53 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  30.43 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.43 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  26.81 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  27.75 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  27.55 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.77 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>