243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0806 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 245 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  99.18 
 
 		 245 aa  510  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  99.59 
 
 		 245 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  90.98 
 
 		 245 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  89.75 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  88.98 
 
 		 245 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  88.98 
 
 		 245 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  88.98 
 
 		 245 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  79.51 
 
 		 245 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  76.73 
 
 		 245 aa  407  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  76.33 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  76.33 
 
 		 245 aa  400  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  75.1 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  70.49 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  70.49 
 
 		 247 aa  377  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  71.02 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  69.26 
 
 		 245 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  69.26 
 
 		 245 aa  362  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  68.44 
 
 		 244 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  94.19 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  56.97 
 
 		 244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  51.84 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  44.08 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  40.71 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  41.46 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  41.63 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  41.63 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  44.21 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  40.54 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  38.62 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  38.37 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  94.12 
 
 		 68 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 433 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 409 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 		 415 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.25 
 
 		 409 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  28.07 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 		 420 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.07 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  29 
 
 		 409 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  28.88 
 
 		 410 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  28.76 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  28.76 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.24 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.64 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  29 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  28.09 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  28.7 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  38.61 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.34 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.39 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.64 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  30.13 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.86 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  32.45 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  24.22 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  26.45 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  32.48 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.79 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.48 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.48 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.48 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.81 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  25.75 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  26.03 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  24.64 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  23.93 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  25.48 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  25.81 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  23.36 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  23.97 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  27.53 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  24.46 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  26.69 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  25.99 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  26.05 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  24.69 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  27.36 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.05 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.05 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.94 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  28.36 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  27.72 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  23.9 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>