187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0826 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 245 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  84.9 
 
 		 245 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  82.45 
 
 		 245 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  76.33 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  77.14 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  75.51 
 
 		 245 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  75.92 
 
 		 245 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  75.82 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  74.69 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  74.69 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  74.69 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  75.1 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  75.41 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  68.98 
 
 		 245 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  70.08 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 247 aa  361  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  66.8 
 
 		 245 aa  355  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  63.52 
 
 		 245 aa  343  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  79.65 
 
 		 172 aa  294  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  55.74 
 
 		 244 aa  294  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  51.25 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  43.39 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  38.74 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  39.56 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  39.43 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  39.77 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  40.44 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  36.03 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  34.96 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  67.65 
 
 		 68 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.38 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  30.33 
 
 		 409 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.13 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  26.94 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  27.71 
 
 		 413 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.42 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  29.92 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  26.84 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.33 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  29.65 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  23.87 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  23.46 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  25.57 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  29.03 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  26.97 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33.55 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  23.67 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  26.73 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  27.52 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  28.29 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  24.61 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  24.9 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.63 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  31.82 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  24.79 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  27.07 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  26.85 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.53 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  23.75 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  24.17 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.32 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  23.04 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  24.03 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  26.16 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  26.05 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  24.15 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  24.47 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>