205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3507 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  99.18 
 
 
245 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  93.85 
 
 
245 aa  480  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  88.98 
 
 
245 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  88.16 
 
 
245 aa  460  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  88.57 
 
 
245 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  79.92 
 
 
245 aa  417  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  76.73 
 
 
245 aa  407  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  74.69 
 
 
245 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  75.51 
 
 
245 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  73.06 
 
 
245 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  68.03 
 
 
245 aa  371  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  71.31 
 
 
245 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  68.85 
 
 
247 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  70.61 
 
 
245 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  68.03 
 
 
245 aa  358  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  65.57 
 
 
244 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  88.37 
 
 
172 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  54.1 
 
 
244 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  52.65 
 
 
248 aa  265  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  41.87 
 
 
248 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  40.32 
 
 
269 aa  206  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  41.63 
 
 
245 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  40 
 
 
246 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  39.59 
 
 
246 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  39.06 
 
 
275 aa  187  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  41.77 
 
 
289 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  36.99 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 
246 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  86.76 
 
 
68 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.17 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
409 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  27.73 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  28.15 
 
 
409 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  24.69 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
433 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  29.06 
 
 
413 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  25.94 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  33.68 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  28.63 
 
 
413 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  26.64 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.71 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  27.71 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  26.78 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
407 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.21 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.85 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.11 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  25.31 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  30.46 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  24.07 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  30.46 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  26.64 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  30.46 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  30.46 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  34.23 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  26 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  25.46 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  30.46 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  27.35 
 
 
411 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
299 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  26.84 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  24.23 
 
 
276 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  22.17 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  29.14 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.34 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  25.45 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  25.61 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  26.02 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  28.37 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  23.93 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  22.87 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  26.95 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  25.11 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  24.4 
 
 
275 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  25.62 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  27.74 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  25.62 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  25.62 
 
 
326 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>