219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0613 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 244 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  70.08 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  358  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  68.44 
 
 		 245 aa  358  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  68.44 
 
 		 245 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  67.62 
 
 		 245 aa  355  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  67.21 
 
 		 245 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  67.21 
 
 		 245 aa  348  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  67.21 
 
 		 245 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  65.53 
 
 		 245 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  66.39 
 
 		 245 aa  338  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  65.57 
 
 		 245 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  66.38 
 
 		 245 aa  332  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  63.4 
 
 		 247 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  56.85 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  68.02 
 
 		 172 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  52.77 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  41.27 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  44.74 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  44.44 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  42.98 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  45.21 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  44.29 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  40.49 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  39.5 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  36.73 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.2 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.75 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  29.95 
 
 		 410 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  32.16 
 
 		 409 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.7 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  29.07 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 		 409 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  28.93 
 
 		 407 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 409 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 420 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  29.82 
 
 		 413 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  29.82 
 
 		 413 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  29.24 
 
 		 415 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.27 
 
 		 407 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  31.35 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 		 415 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  62.69 
 
 		 68 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 433 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  30.8 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  28.76 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  29.6 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  27.57 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  36.51 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.38 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  28.04 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  28.04 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  27.51 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.92 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  28.44 
 
 		 411 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  30.72 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  26.98 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  28.88 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  26.87 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  26.73 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  23.81 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10371  dienelactone hydrolase  28.42 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  24.88 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  25.43 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  29.08 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  30 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  23.65 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  26.72 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  26.72 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.13 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  25.12 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  27.36 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.11 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.13 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.13 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.13 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.13 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>