More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2614 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 262 aa  510  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  65.9 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  57.89 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  42.98 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  42.06 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  47.64 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0147  dienelactone hydrolase  38.72 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  34.65 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  34.36 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  36.64 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 		 275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  33.77 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  36.65 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  33.77 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01840  dienelactone hydrolase-like enzyme  38.97 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.470749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  33.04 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  35.91 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  34.39 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  33.04 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  37.22 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  36.49 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  33.04 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  34.18 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  34.18 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  35.32 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  34.43 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  36.32 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  34.27 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  32.61 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  32.14 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  32.87 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  34.18 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  32.61 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  34.26 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  29.53 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  34.43 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  32.48 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  31.17 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.96 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  37.56 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  29.28 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  33.77 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  34.07 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  37.61 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  35.91 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  35.91 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  33.78 
 
 		 222 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  27.23 
 
 		 214 aa  92.4  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  32.42 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  36.53 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 		 244 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 339 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  35.98 
 
 		 242 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  31.33 
 
 		 339 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.38 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  35.11 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.77 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  30.9 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  32.11 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  32.11 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>