257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0147 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0147  dienelactone hydrolase  100 
 
 
227 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01840  dienelactone hydrolase-like enzyme  56.39 
 
 
221 aa  228  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.470749  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  41.82 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  40.76 
 
 
246 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  38.67 
 
 
272 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  38.77 
 
 
262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  35.95 
 
 
254 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  42.47 
 
 
238 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  30.77 
 
 
290 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
290 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  30.34 
 
 
290 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  31.62 
 
 
275 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.9 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.85 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  31.6 
 
 
280 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
294 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  32.41 
 
 
290 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.85 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.85 
 
 
267 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.85 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.91 
 
 
278 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.85 
 
 
271 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 
297 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32.85 
 
 
271 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 
297 aa  92  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  32.37 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  34.11 
 
 
290 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  32.86 
 
 
290 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 
298 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  34.3 
 
 
268 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  30.05 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.71 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.89 
 
 
251 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
291 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
291 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.06 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  33.81 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  31.36 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  32.08 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  30.67 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  24.48 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  31.39 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  29.25 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  22.9 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  30.19 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  24.07 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  30.19 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  31.31 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  30.93 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
292 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  30.08 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
290 aa  71.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  31.67 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  24.64 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  24.26 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  31.17 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.43 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  25.44 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  28.45 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  26.89 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.1 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  29.82 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  24.06 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  28.02 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>