More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2726 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2133  dienelactone hydrolase  51.81 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2526  dienelactone hydrolase  46.34 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  43.95 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2526  carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  36.46 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  35.37 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 291 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  34.17 
 
 		 295 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.86 
 
 		 295 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  32.56 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  32.52 
 
 		 295 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 		 295 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  31.86 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  32.04 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  32.04 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  31.55 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  29.29 
 
 		 290 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  29.29 
 
 		 290 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  30.54 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 		 290 aa  85.1  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5691  Carboxymethylenebutenolidase  34.38 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  30.08 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  26.05 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  33.95 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  27.38 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  27.38 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  27.38 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  27.38 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  31.14 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  32.5 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.45 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  28.34 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  30.54 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.39 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.39 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.39 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.39 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.39 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.37 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3034  dienelactone hydrolase  31 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  26.84 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.39 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30.7 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0846  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269647  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  25.21 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  30.1 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  29.28 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  29.44 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  29.15 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  29.15 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  27.44 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  26.78 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  28.38 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  28 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  26.56 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  29.54 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2750  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0604874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2794  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2780  carboxymethylenebutenolidase  30.35 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  27.49 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 		 291 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  30.69 
 
 		 320 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  26.58 
 
 		 291 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.93 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3311  dienelactone hydrolase  29.35 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.162342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  26.94 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  29.36 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07760  dienelactone hydrolase-like enzyme  23.91 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  25.35 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  29.25 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  25.35 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>