More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07760  dienelactone hydrolase-like enzyme  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.14 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  28.26 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  29.2 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  26.87 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  28.82 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  33.5 
 
 
411 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  31.22 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  30.39 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  31.03 
 
 
415 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  27.9 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  27.45 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  27.67 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  28.83 
 
 
407 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  28.23 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 
278 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  30.24 
 
 
415 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.04 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.04 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.04 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.04 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  24.44 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.5 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  23.91 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  25.42 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  26.13 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  26.24 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  26.59 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  26.59 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  25.52 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  25.52 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  24.66 
 
 
410 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  26.13 
 
 
413 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  25.1 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  26.52 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  24.36 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  26.26 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  24.68 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  24.78 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  26.64 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  24.68 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  25.84 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  26.97 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  26.5 
 
 
420 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  27.65 
 
 
409 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  25.97 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.89 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.12 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  24.89 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  24.78 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  24.88 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 
433 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  26.55 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  28.17 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  23.55 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  25.1 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  24.17 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  24.64 
 
 
290 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  24.64 
 
 
290 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2379  dienelactone hydrolase  29.02 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381167  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  26.11 
 
 
236 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  24.76 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  22.03 
 
 
214 aa  62  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  23.5 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  28.71 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  24.52 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  24.27 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  24.88 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  25 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  26.03 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6472  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>